Мозжечок на срезах состоит из серого и белого вещества. Серое вещество в виде тонкого слоя покрывает извилины и формирует серые ядра мозжечка.
Белое вещество залегает внутри мозжечка в виде массивного скопления. Разветвляясь к периферии, оно проникает в каждую извилину в виде мозговых пластинок.
На срезе червя это характерное сочетание белого и серого вещества получило название древа жизни.
В белом веществе мозгового тела мозжечка располагаются парные скопления нервных клеток.
Различают зубчатое ядро, пробковидное ядро, шаровидное ядро и ядро шатра. Мозжечок связан с другими отделами мозга с помощью трех пар ножек.
Передние ножки мозжечка направлены к среднему мозгу и его четверохолмию.
Средние ножки, именуемые ручками моста, идут от моста к мозжечку.
Задние ножки направляются от продолговатого мозга к мозжечку и называются веревчатыми телами.
Продолговатый мозг расположен впереди и под мозжечком. Между ними находится полость четвертого желудочка, дном которого служит ромбовидная ямка, а задней стенкой — шатер, примыкающий к червю мозжечка.
Верхний, расширенный конец продолговатого мозга направлен к среднему мозгу, а суженный конец переходит в спинной мозг.
Фактически продолговатый мозг является продолжением спинного мозга к головному мозгу.
Границей между ними служит выход корешков первого шейного нерва.