С пищеварительной системой тесно связана структурно и топографически система органов дыхания. У всех позвоночных органы дыхания связаны с глоточным отделом кишечника. У рыб в области глотки открываются парные жаберные щели с жаберными лепестками внутри.
Вода, омывая пронизанные кровеносными сосудами лепестки, снабжает кровь растворенным в воде кислородом. В связи с переходом к воздушному образу жизни у вышестоящих классов развивается особый аппарат дыхания — легкие, которые, как было сказано ранее, в своем развитии у амфибий тесно связаны с последними жаберными карманами.
У всех остальных, вплоть до млекопитающих и человека, легкие развиваются из продольной складки вентральной стенки глотки.
Таким образом, органы дыхания развиваются в качестве выроста начальной части кишечного канала и, как мы видим, часть пути является общей для воздуха и для пищи.
Можем ли мы априорно, исходя из знания условий, в которых протекает функция дыхания, составить себе представление об основных чертах строения аппарата дыхания? Вспомним, что растение, омывающееся пищей, для ее освоения нуждается только в увеличении поверхности соприкосновения, что сказывается в ветвлении корней и кроны.
Органы дыхания находятся по отношению к кислороду в таком же отношении, в каком находятся растения по отношению ко всем родам их пищи.
Таким образом, здесь заранее можно ожидать ясно выраженного сходства в строении. Это сходство мы и видим.
Аппарат дыхания личинок некоторых рыб и амфибий, наружные жабры, по внешнему виду прямо напоминает пучок разветвленных корней дерева, что увеличивает поверхность, соприкасающуюся с водой, содержащей кислород.